软 件 资 源

数据库

Wheat-SnpHub-Portal

小麦属变异组数据库门户
(GigaScience, 2020)

WheatUnion

小麦重测序变异组联合数据库
(2020, 合作)

WheatCompDB

小麦种质资源血缘比较数据库
(Plant Physiology, 2022)

Triticeae-GeneTribe

小麦族同源基因数据库
(Molecular Plant, 2020)

wGRN

小麦整合基因调控网络数据库
(Molecular Plant, 2023)

wLNCdb

小麦长链非编码RNA数据库
(Seed Biology, 2023)

pNOGmap

禾本科核基因组内细胞器来源基因数据库
(Plant Physiology, 2023)

WheatCNVb

小麦 CNVb 指纹数据库

软件资源

SnpHub

变异组开源数据库模型
(GigaScience, 2020)

ggComp

作物种质资源血缘一致区间鉴定工具
(Plant Physiology, 2020)

IntroBlocker

基因组渗入区间鉴定算法
(Nature Communications, 2022)

GeneTribe

泛基因组水平同源基因推断工具
(Molecular Plant, 2020)

IGTminer

核基因组内细胞器来源基因的演化轨迹鉴定工具
(Plant Physiology, 2023)

PanSK

基于K-mer的全基因组水平小麦SSP基因PAV和单倍型鉴定方法

数据集

西藏小麦测序计划

藏1817基因组组装及群体重测序数据
(Nature Communications, 2020)

Grain Translatome Browser

小麦籽粒发育翻译组的基因组浏览器
(Plant cell, 2023)

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