软 件 资 源

数据库 / 网页服务

Wheat-SnpHub-Portal

小麦属变异组数据库 / 网页服务门户
(GigaScience, 2020)

WheatUnion

小麦重测序变异组联合数据库 / 网页服务
(2020, 合作)

WheatCompDB

小麦种质资源血缘比较数据库 / 网页服务
(Plant Physiology, 2022)

Triticeae-GeneTribe

小麦族同源基因数据库 / 网页服务
(Molecular Plant, 2020)

wGRN

小麦整合基因调控网络数据库 / 网页服务
(Molecular Plant, 2023)

wLNCdb

小麦长链非编码RNA数据库 / 网页服务
(Seed Biology, 2023)

pNOGmap

禾本科核基因组内细胞器来源基因数据库 / 网页服务
(Plant Physiology, 2023)

WheatCNVb

小麦 CNVb 指纹数据库 / 网页服务
(Genome Biology, 2024)

DualPE-Finder

植物基因组编辑工具
用于缺失、替换和倒位的设计
(Nature Plants, 2024)

软件资源

SnpHub

变异组开源数据库 / 网页服务模型
(GigaScience, 2020)

ggComp

作物种质资源血缘一致区间鉴定工具
(Plant Physiology, 2020)

IntroBlocker

基因组渗入区间鉴定算法
(Nature Communications, 2022)

GeneTribe

泛基因组水平同源基因推断工具
(Molecular Plant, 2020)

IGTminer

核基因组内细胞器来源基因的演化轨迹鉴定工具
(Plant Physiology, 2023)

PanSK

基于K-mer的全基因组水平小麦SSP基因PAV和单倍型鉴定方法

数据集

西藏小麦测序计划

藏1817基因组组装及群体重测序数据
(Nature Communications, 2020)

Grain Translatome Browser

小麦籽粒发育翻译组的基因组浏览器
(Plant cell, 2023)

Go to Top
+